Bojan adalah jebolan akademi Barcelona “La Masia” dan mencetak 900 gol di tingkat junior hingga sempat digadang-gadang menjadi “Lionel Messi selanjutnya” oleh media saat itu.

Dia kemudian menembus tim utama Barcelona dan meraih banyak trofi, dia mencetak 41 gol dalam 163 penampilan dalam kurun waktu empat musim di tim utama Barca.

Namun, kariernya mulai meredup karena cedera dan kesehatan mental. Dia mengungkapkan bahwa dia sering mengalami serangan kecemasan karena mendapatkan banyak soroton setelah melakukan debut di tim senior Barcelona.

Dia kemudian dipinjamkan Barcelona ke AC Milan dan Ajax sebelum gabung Stoke City secara permanen pada 2014. Dia terus berpindah-pindah klub sebelum bergabung dengan klub asal Jepang Vissel Kobe pada 2021, yang menjadi tempat dia bermain dengan mantan rekan setimnya di Barcelona Andres Iniesta.